מענקים מטעם קרן אמירה ומיכאל דן ניתנים לסטודנטים במסלול מחקרי בתכנית לניהול מערכות חינוך. בשנים האחרונות ניתנו מענקים לצורך כיסוי הוצאות הכרוכות בכתיבת תיזה ומענק לתיזה מצטיינת.